S obnovom franjevačkog kompleksa, pored stambenog trakta redovnika i klauzure, otvorio se i prostor za muzej u koji su uvršteni riznica s vrijednim umjetničkim blagom, galerija slika starih majstora, knjižnica raritetnih knjiga, a posjetiteljima je omogućen pristup crkvi, kripti, zvoniku i klaustru, novoj knjižnici s čitaonicom te ostalim sadržajima poput vinoteke i suvenirnice, uključujući i vanjski prostor u kojem se nalazi Pastoralni centar sv. Bono i šetnica s pogledom na Dunav.

Tim projektom koji je započeo 2017. godine, Franjevački muzej s već posvećenom crkvom sv. Filipa i Jakova otkriva novu dimenziju u bogatoj kulturnoj i povijesnoj baštini Vukovara.

Virtualni obilazak muzeja:

https://franjevacki-samostan-vukovar.hr/fmv360/